水冷式压缩机几乎无需利用工厂的通风系统，因为冷却水可以带走电动机产生的大约 90% 的热能。

不带循环水的开放式系统需要外部水源，比如市政供水管道、湖泊、河流或井水等。冷却水在流经压缩机后排出。

使用此方法时，系统需要自动调温控制装置来保持所需的空气温度和控制用水量。通常，开放式系统易于安装且节约成本。不过，它的运行成本很高，尤其是当冷却水来自市政供水时。

湖泊或河流中的水虽然一般免费，但需要过滤和净化以降低冷却系统堵塞风险。此外，富含氧化钙的水质还可能导致冷却器内部形成水垢，影响冷却效果。含盐水也存在同样的问题，当系统设计合理并且规格选择得当时，也可以使用含盐水。

在带循环水的开放式系统中，从压缩机流出的冷却水会在开放式冷却塔中重新冷却。在此过程中，会对腔室进行风冷，所以有一部分水会蒸发。剩余的水则被冷却至低于环境温度 2˚C（取决于外部因素，包括湿度）。

带循环水的开放式系统主要在外部供水有限时使用。这种系统的缺点是水会逐渐被周围空气污染。此外，由于水会蒸发，必须不断地使用外部水对系统进行补水。

还有一个缺点，可溶解的盐会在压缩机的高温金属表面沉积，降低冷却塔的导热能力。此外，还需要定期对水进行分析和化学处理，以避免藻类滋生。

在冬季，当压缩机不工作时，必须将水排净或进行加热，以防止结冰。

在封闭式冷却系统中，水在压缩机和外接热交换器之间持续循环，热交换器则由外部水回路或周围空气进行冷却。

由水回路对水进行冷却时，会使用平板式热交换器。由周围空气进行冷却时，则使用由管道和散热片组成的冷却结构。周围空气在一个或多个风扇的作用下，被强制循环流过管道和散热片。当可用的冷却水有限时，适合采用此方法。

开放式和封闭式回路的冷却能力大致相当，压缩机水将被冷却至高于冷却液温度 5°C。如果由周围空气对水进行冷却，需要使用防冻剂（例如乙二醇）。

封闭式冷却水系统需要加注纯净软化水。如果使用乙二醇，必须重新计算压缩机系统的水流量。乙二醇的类型和浓度会影响水的热容和粘度。

首次加水之前，还必须对系统进行清洁。如果实施得当，封闭式冷却水系统只需很少的监管，而且维护成本很低。

如果提供的冷却水具有潜在腐蚀性，则冷却器应采用耐腐蚀材料，比如铬合金。

如简介中所述，大多数现代压缩机成套设备还会提供风冷式机型。这种机型会在空气压缩机内部进行强制通风。

在这种情况下，风扇的持续运行会导致较高的能耗。但是，风冷式压缩机往往更清洁，因为流经设备的污染物更少。

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